Die Gründung der Schule am Selenter See erfolgte im Jahre 1967 als „Dörfergemeinschaftsschule Selent“. Sechs Jahre später wurde sie dann in „Grund- und Hauptschule Selent“ umbenannt und hatte in dieser Form bis zum Jahr 2005 Bestand. Verbunden mit gleichzeitigen umfangreichen Sanierungs-, Neu- und Anbautätigkeiten wurde im selbigen Jahr die erste Klasse des neu hinzugekommenen Realschulzweiges eingeschult und der Schulname mit „Schule am Selenter See – Grund- und Hauptschule mit Realschulteil“ erneut der geänderten Situation angepasst. Seit diesem Schritt weisen die Jahrgänge der weiterführenden Schule auch, wie die Klassenstufen der Grundschule, grundsätzlich zwei Parallelklassen auf. Neben den drei Schulzweigen, die sich im Schulnamen niederschlagen, fand und findet bis zum heutigen Tage auch die Beschulung von Förderschülern statt, anfangs durch eine eigenständige Förderschule, inzwischen im Rahmen einer ausgegliederten Förderschulklasse des Förderzentrums Lütjenburg und integrativer Beschulung in der Sekundarstufe. Die Schüler kommen aus den fünf Schulträgergemeinden, sowie inzwischen zehn weiteren Gemeinden des Umlandes.

Im Verlaufe der baulichen Veränderungen der vergangenen Jahre fand auch eine Modernisierung der Schulstruktur statt, so dass die Schule heute einen offenen Ganztagsschulbetrieb mit eigener Schulküche und einem umfangreichen, etwa von der Hälfte der Schüler angenommenen Nachmittagsangebot „Albatros“ ebenso umfasst, wie eine der ersten Ferienbetreuungen Schleswig-Holsteins. Weiterhin wird auch eine Frühbetreuung vor Unterrichtsbeginn angeboten, welche unter dem Namen „Betreute Grundschule“ schon eine langjährige Tradition in dieser Einrichtung aufweist. Alles in allem kann so allen Schülern eine umfassende Betreuung für den Zeitraum von 7.00 bis 15.45 Uhr(freitags bis 14.30 Uhr) angeboten werden.

Seit dem Schuljahr 2008/09 ist die Schule am Selenter See eine der ersten beiden Regionalschulen des Kreises Plön.

Für die stetig steigende Schülerzahl von mittlerweile 315 Schülerinnen und Schülern im Schulahr 2008/09 stehen auf dem mittlerweile gut genutzten, großzügigen Schulgelände neben den 17 Klassenräumen zzgl. einiger Gruppenräume, sowie dem Verwaltungstrakt und dem Speisesaal, neu eingerichtete Fachräume für die informationstechnische Grundbildung, die Lehrküche und die Naturwissenschaften zur Verfügung. Die vorhandenen anderen Fachräume wurden im Rahmen der Umbauarbeiten saniert und neu ausgestattet. Der mit vielfältigen Spielgeräten ausgestattete und z. T. begrünte Pausenhof wird zusammen mit zwei weiteren, u. a. als „Klassenräume im Freien“, hergerichteten Grünflächen, durch den Sportplatz und das DFB- gesponserte Speed-Soccerfeld erweitert. Dies unterstreicht „Bewegung und Spiel“ als einen der Schulschwerpunkte, ebenso wie der Neubau einer großen Zweifeldsporthalle mit Tribüne. Hierdurch konnte die zentral innerhalb des Schulgebäudes gelegene alte Sporthalle zu einer von Theater-AGs und der Schulband rege genutzten Aula mit Bühne und dem Aufenthaltsraum der Frühbetreuung umgewidmet werden.

Neben dem offiziell geforderten schrittweise neu einzuführenden jahrgangsübergreifenden Unterricht in den Klassen 1 und 2, dem Englischunterricht in den Klassen 3 und 4, bietet das Schulkonzept durch umfangreiche Stützkurse an der Grundschule, einer schwerpunktmäßigen Leseförderung durch das Programm NZL und einer wöchentlichen Lesestunde für alle Schüler, sowie einer früh einsetzenden und umfangreichen Berufsorientierungsphase auch für Realschüler zusätzlich vielfältige eigene Initiativen, um die  Schülerinnen und Schüler für die Anforderungen der heutigen Arbeitswelt besser zu rüsten.